热烈祝贺第一期思萃免疫所&及智医学单细胞、空间转录组、三代单细胞全长生信培训班
7月21日至22日,思萃免疫技术研究所成功举办了为期2天的‘单细胞、空间转录组、三代单细胞全长生信培训班’。近30位硕博生、临床医生和业内知名生物公司领导盛情相聚在苏州太仓星药港。
开班首日苏州思萃免疫技术研究所常务副所长及总经理梁辉博士为大家介绍了思萃的成长和发展。思萃在政府及学术各界的大力支持下蓬勃发展。梁博为我们介绍了思萃的业务范围并强调思萃和及智将为大家提供高质量的科研服务和公共实验平台,期待与各位老师,医生及公司开展项目合作。最后梁博对大家的到来表示热烈的欢迎,并预祝大家在两天的学习中可以收获满满。
在项目经验分享阶段,我们邀请到了上海市免疫学研究所助理研究员,杜艳华博士为我们做单细胞的经典案例剖析和分析经验分享。杜博介绍了自己在Nature、The EMBO Journal等杂志上发表的研究工作,并总结了自己的数据分析成功经验:“准备好、多讨论”。杜博强调,好的实验是数据分析的关键和基础,分析结果的交叉实验验证更是项目必不可少的收尾环节。最后杜博表示期待与大家进行项目探讨和合作,并欢迎大家加入上海市免疫学研究所Ye Lab。
我们还邀请了上海市免疫学研究所研究员叶幼琼博士为我们带来“单细胞及空间转录测序的数据挖掘”。叶幼琼博士毕业于同济大学生物信息学专业,上海市浦江人才,现为上海市免疫学研究所肿瘤多组学与免疫治疗组组长、研究员。叶老师分别从单细胞和空间转录组两个方面进行了数据分析的原理介绍和技术总结,对数据分析的每个步骤,进行不同分析算法工具原理简介并进行多维度的比较。并详细介绍了Ye Lab开发的空间转录组数据解卷积算法Cottrazm (https://github.com/Yelab2020/Cottrazm)。
在培训实操阶段,及智医学总经理程小涛和生信工程师章燕为我们带来了精彩的代码实操演示。从数据读取开始带领大家层层递进,从安装R软件到单细胞高级分析,一起进行头脑风暴,让无任何R语言基础的技术研究人员也能轻松上手单细胞的基础和高级数据分析。程老师的课幽默有趣,深入浅出,赢得了广大学员的一致好评。
在第二天的培训环节,继续为学员们带来了单细胞的高级分析代码Cellchat,一个步骤生成所有通路的细胞互作图片,赢得了一致好评。在单细胞的分析学习基础上,程老师又带来了进阶版的空间转录组的分析介绍和代码学习。有了单细胞的数据经验,学员们更加得心应手,快速掌握了空间转录组的基础和高级分析流程和代码。
培训班最后,我们重磅推出了三代全长单细胞的分析经验介绍和技术分享。这也是业内首次进行全长单细胞的分析培训和代码实操。
本次培训圆满完成,感谢各位领导老师同学的支持与配合。期待下期与您再会!